L'archipel de Faeloria est traversé par les Veines — des courants de magie brute (terre, eau, air) sur lesquels toute vie et toute magie reposent.
Depuis une génération, les Veines se fracturent : des poches de magie instable apparaissent, des chemins se déforment, des lieux autrefois sûrs deviennent dangereux. Six traditions sont nées en réponse à cette fracture, chacune avec sa méthode pour composer avec une magie devenue instable — historiquement rivales et méfiantes les unes des autres.
Le joueur incarne un(e) jeune apprenti(e) d'une tradition, envoyé(e) enquêter sur des perturbations croissantes à travers les îles. Il devient vite clair que la fracture n'est pas naturelle — quelque chose l'accélère délibérément. Les traditions sont forcées de coopérer malgré leur méfiance mutuelle.
C'est le récit que raconte Faeloria 2D : la naissance du conflit, la découverte de la vérité sur l'Ordre du Sceau, et la question qui hante la fin de cette histoire — réparer les Veines à la manière des Tisseurs pourrait, sans le vouloir, donner à l'Ordre le point de rupture définitif qu'il cherche.